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自动粪菌分离仪，人一出生即有微生物在体表和体内定植，大部分微生物定植于肠道。健康成年人粪便干重的70%由细菌组成。可想而知，这个数量有多庞大！正常肠道菌群由细菌、古生菌和真菌组成。人类肠道微生物基因数目是人类基因的150倍，细菌数目是人体细胞的10倍，其中超过99%来自细菌，共发现有超过1000种细菌。
肠道菌群被称为“器官中的器官”。潜意识里，人们总把细菌当成“坏分子”，认为细菌会引起感染、炎症等疾病，恨不得把它赶尽杀绝。其实恰恰相反，绝大部分肠道菌群不仅对人体无害，反而是有益的甚至必不可少的。肠道菌群对宿主免疫反应的成熟与强化、抵御病原菌入侵、调节肠道内分泌反应，以及能量代谢调节等多方面均有深刻影响。肠道菌群紊乱可导致慢性腹泻、便秘等常见疾病的发生。有一个例子，可能大家会比较熟悉：长期应用广谱抗sheng素可能导致慢性腹泻，这就是肠道菌群紊乱引起的。近年来还发现肠道菌群紊乱与自身免疫性疾病、儿童自闭症也密切相关。肠道菌群紊乱了怎么办呢？在这方面可能大家也会有一些经验，比如喝喝酸奶、吃吃益生菌。这些都是通过补充益生菌来纠正肠道菌群。但是通过这种方式补充的益生菌种类比较单一。前面我们已经提到，肠道里面细菌种类超过1000种，显然不可能通过这种方式得到补充和恢复。那么，肠道菌群紊乱了就需要菌群的整体移植来解决。

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